Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms