Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB1P08034 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB1P08034 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB1P08034 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB1P08034 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB1P08034 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB1P08034 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB1P08034 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB1P08034 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB1P08034 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB1P08034 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB1P08034 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB1P08034 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB1P08034 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB1P08034 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB1P08034 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB1P08034 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB1P08034 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB1P08034 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB1P08034 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB1P08034 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB1P08034 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB1P08034 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB1P08034 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB1P08034 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB1P08034 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB1P08034 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB1P08034 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB1P08034 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB1P08034 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB1P08034 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB1P08034 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB1P08034 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB1P08034 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB1P08034 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB1P08034 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB1P08034 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB1P08034 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB1P08034 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB1P08034 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB1P08034 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB1P08034 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB1P08034 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB1P08034 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB1P08034 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB1P08034 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB1P08034 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB1P08034 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB1P08034 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB1P08034 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB1P08034 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB1P08034 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB1P08034 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB1P08034 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB1P08034 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB1P08034 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB1P08034 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB1P08034 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB1P08034 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB1P08034 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB1P08034 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB1P08034 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB1P08034 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB1P08034 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB1P08034 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB1P08034 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB1P08034 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB1P08034 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB1P08034 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB1P08034 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB1P08034 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB1P08034 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB1P08034 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB1P08034 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB1P08034 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB1P08034 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB1P08034 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB1P08034 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB1P08034 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB1P08034 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB1P08034 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB1P08034 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB1P08034 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB1P08034 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB1P08034 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB1P08034 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB1P08034 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB1P08034 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB1P08034 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB1P08034 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB1P08034 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB1P08034 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB1P08034 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB1P08034 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB1P08034 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB1P08034 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB1P08034 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB1P08034 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB1P08034 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB1P08034 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms