Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPM2P07951 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPM2P07951 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TPM2P07951 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPM2P07951 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPM2P07951 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPM2P07951 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPM2P07951 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPM2P07951 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPM2P07951 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPM2P07951 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPM2P07951 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPM2P07951 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPM2P07951 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPM2P07951 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPM2P07951 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPM2P07951 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPM2P07951 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPM2P07951 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPM2P07951 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPM2P07951 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPM2P07951 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPM2P07951 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPM2P07951 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPM2P07951 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPM2P07951 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPM2P07951 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPM2P07951 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPM2P07951 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPM2P07951 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPM2P07951 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPM2P07951 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPM2P07951 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPM2P07951 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TPM2P07951 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPM2P07951 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPM2P07951 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPM2P07951 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPM2P07951 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPM2P07951 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPM2P07951 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPM2P07951 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPM2P07951 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPM2P07951 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPM2P07951 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPM2P07951 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPM2P07951 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPM2P07951 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPM2P07951 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPM2P07951 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPM2P07951 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPM2P07951 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPM2P07951 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPM2P07951 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPM2P07951 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPM2P07951 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPM2P07951 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPM2P07951 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPM2P07951 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPM2P07951 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPM2P07951 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPM2P07951 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPM2P07951 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPM2P07951 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPM2P07951 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPM2P07951 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPM2P07951 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPM2P07951 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPM2P07951 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPM2P07951 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPM2P07951 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPM2P07951 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPM2P07951 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPM2P07951 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPM2P07951 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPM2P07951 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TPM2P07951 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPM2P07951 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPM2P07951 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPM2P07951 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPM2P07951 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPM2P07951 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPM2P07951 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPM2P07951 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPM2P07951 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPM2P07951 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPM2P07951 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPM2P07951 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPM2P07951 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPM2P07951 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPM2P07951 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPM2P07951 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TPM2P07951 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPM2P07951 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPM2P07951 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPM2P07951 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPM2P07951 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TPM2P07951 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TPM2P07951 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TPM2P07951 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms