Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms