Protein–RNA interactions for Protein: P05452

CLEC3B, Tetranectin, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC3BP05452 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLEC3BP05452 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms