Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms