Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG12O94817 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG12O94817 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG12O94817 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG12O94817 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG12O94817 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG12O94817 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG12O94817 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG12O94817 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG12O94817 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG12O94817 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG12O94817 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG12O94817 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG12O94817 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG12O94817 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG12O94817 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG12O94817 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG12O94817 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG12O94817 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG12O94817 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG12O94817 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG12O94817 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG12O94817 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG12O94817 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG12O94817 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG12O94817 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG12O94817 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG12O94817 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG12O94817 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG12O94817 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG12O94817 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG12O94817 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG12O94817 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG12O94817 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG12O94817 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG12O94817 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG12O94817 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG12O94817 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG12O94817 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG12O94817 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG12O94817 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG12O94817 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG12O94817 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG12O94817 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG12O94817 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG12O94817 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG12O94817 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG12O94817 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG12O94817 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG12O94817 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG12O94817 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG12O94817 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG12O94817 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG12O94817 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG12O94817 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG12O94817 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG12O94817 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG12O94817 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATG12O94817 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATG12O94817 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATG12O94817 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATG12O94817 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG12O94817 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG12O94817 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG12O94817 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG12O94817 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG12O94817 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG12O94817 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG12O94817 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG12O94817 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG12O94817 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG12O94817 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG12O94817 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG12O94817 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG12O94817 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG12O94817 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG12O94817 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG12O94817 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG12O94817 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG12O94817 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG12O94817 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG12O94817 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG12O94817 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG12O94817 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG12O94817 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG12O94817 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG12O94817 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG12O94817 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG12O94817 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG12O94817 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG12O94817 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG12O94817 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG12O94817 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG12O94817 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG12O94817 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG12O94817 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG12O94817 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG12O94817 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG12O94817 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG12O94817 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms