Protein–RNA interactions for Protein: O75177

SS18L1, Calcium-responsive transactivator, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L1O75177 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms