Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IGSF3O75054 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms