Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms