Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HTRA2O43464 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms