Protein–RNA interactions for Protein: O43448

KCNAB3, Voltage-gated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB3O43448 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNAB3O43448 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms