Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIAH2O43255 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIAH2O43255 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIAH2O43255 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIAH2O43255 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SIAH2O43255 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIAH2O43255 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIAH2O43255 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIAH2O43255 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIAH2O43255 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIAH2O43255 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIAH2O43255 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIAH2O43255 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIAH2O43255 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIAH2O43255 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIAH2O43255 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIAH2O43255 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms