Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEFVO15553 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEFVO15553 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEFVO15553 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEFVO15553 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEFVO15553 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEFVO15553 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEFVO15553 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEFVO15553 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MEFVO15553 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MEFVO15553 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEFVO15553 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEFVO15553 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEFVO15553 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEFVO15553 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEFVO15553 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEFVO15553 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEFVO15553 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEFVO15553 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEFVO15553 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEFVO15553 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEFVO15553 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEFVO15553 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEFVO15553 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEFVO15553 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEFVO15553 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEFVO15553 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEFVO15553 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MEFVO15553 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEFVO15553 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEFVO15553 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MEFVO15553 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEFVO15553 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEFVO15553 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEFVO15553 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEFVO15553 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEFVO15553 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEFVO15553 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEFVO15553 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEFVO15553 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEFVO15553 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEFVO15553 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEFVO15553 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEFVO15553 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEFVO15553 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MEFVO15553 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEFVO15553 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEFVO15553 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEFVO15553 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEFVO15553 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEFVO15553 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEFVO15553 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEFVO15553 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEFVO15553 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEFVO15553 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEFVO15553 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEFVO15553 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEFVO15553 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEFVO15553 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MEFVO15553 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEFVO15553 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEFVO15553 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEFVO15553 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEFVO15553 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEFVO15553 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEFVO15553 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEFVO15553 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEFVO15553 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEFVO15553 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEFVO15553 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEFVO15553 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEFVO15553 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEFVO15553 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MEFVO15553 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEFVO15553 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MEFVO15553 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEFVO15553 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEFVO15553 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MEFVO15553 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEFVO15553 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEFVO15553 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEFVO15553 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEFVO15553 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEFVO15553 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEFVO15553 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEFVO15553 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEFVO15553 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEFVO15553 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEFVO15553 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEFVO15553 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEFVO15553 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEFVO15553 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEFVO15553 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEFVO15553 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEFVO15553 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEFVO15553 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEFVO15553 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEFVO15553 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEFVO15553 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEFVO15553 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms