Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA3EO15041 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms