Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLGNO14967 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLGNO14967 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLGNO14967 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLGNO14967 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CLGNO14967 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLGNO14967 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLGNO14967 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLGNO14967 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLGNO14967 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLGNO14967 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLGNO14967 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLGNO14967 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLGNO14967 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLGNO14967 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLGNO14967 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLGNO14967 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLGNO14967 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLGNO14967 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLGNO14967 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLGNO14967 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLGNO14967 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLGNO14967 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLGNO14967 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLGNO14967 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLGNO14967 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLGNO14967 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLGNO14967 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLGNO14967 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLGNO14967 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLGNO14967 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLGNO14967 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLGNO14967 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLGNO14967 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CLGNO14967 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLGNO14967 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLGNO14967 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLGNO14967 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLGNO14967 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLGNO14967 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLGNO14967 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLGNO14967 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLGNO14967 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLGNO14967 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLGNO14967 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLGNO14967 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLGNO14967 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CLGNO14967 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLGNO14967 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLGNO14967 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLGNO14967 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLGNO14967 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLGNO14967 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLGNO14967 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLGNO14967 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLGNO14967 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLGNO14967 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLGNO14967 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLGNO14967 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLGNO14967 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CLGNO14967 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLGNO14967 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLGNO14967 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLGNO14967 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLGNO14967 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLGNO14967 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLGNO14967 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLGNO14967 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLGNO14967 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLGNO14967 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLGNO14967 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLGNO14967 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLGNO14967 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLGNO14967 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLGNO14967 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLGNO14967 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLGNO14967 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLGNO14967 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLGNO14967 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLGNO14967 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLGNO14967 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLGNO14967 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLGNO14967 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLGNO14967 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLGNO14967 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLGNO14967 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLGNO14967 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLGNO14967 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLGNO14967 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLGNO14967 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLGNO14967 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLGNO14967 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLGNO14967 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLGNO14967 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLGNO14967 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLGNO14967 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLGNO14967 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLGNO14967 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLGNO14967 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLGNO14967 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms