Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
IFIT3O14879 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms