Protein–RNA interactions for Protein: O00562

PITPNM1, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNM1O00562 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PITPNM1O00562 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PITPNM1O00562 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PITPNM1O00562 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PITPNM1O00562 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PITPNM1O00562 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PITPNM1O00562 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PITPNM1O00562 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PITPNM1O00562 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PITPNM1O00562 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PITPNM1O00562 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PITPNM1O00562 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PITPNM1O00562 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms