Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms