Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PATL2C9JE40 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms