Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HACD1B0YJ81 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HACD1B0YJ81 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HACD1B0YJ81 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HACD1B0YJ81 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HACD1B0YJ81 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HACD1B0YJ81 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HACD1B0YJ81 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HACD1B0YJ81 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HACD1B0YJ81 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HACD1B0YJ81 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HACD1B0YJ81 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HACD1B0YJ81 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HACD1B0YJ81 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HACD1B0YJ81 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HACD1B0YJ81 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
HACD1B0YJ81 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HACD1B0YJ81 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HACD1B0YJ81 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HACD1B0YJ81 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
HACD1B0YJ81 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
HACD1B0YJ81 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HACD1B0YJ81 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HACD1B0YJ81 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HACD1B0YJ81 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HACD1B0YJ81 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms