Protein–RNA interactions for Protein: A8MU46

SMTNL1, Smoothelin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNL1A8MU46 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMTNL1A8MU46 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMTNL1A8MU46 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMTNL1A8MU46 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMTNL1A8MU46 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMTNL1A8MU46 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMTNL1A8MU46 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMTNL1A8MU46 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMTNL1A8MU46 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMTNL1A8MU46 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SMTNL1A8MU46 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMTNL1A8MU46 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SMTNL1A8MU46 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SMTNL1A8MU46 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SMTNL1A8MU46 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMTNL1A8MU46 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMTNL1A8MU46 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMTNL1A8MU46 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMTNL1A8MU46 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMTNL1A8MU46 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMTNL1A8MU46 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMTNL1A8MU46 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMTNL1A8MU46 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMTNL1A8MU46 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMTNL1A8MU46 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMTNL1A8MU46 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMTNL1A8MU46 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms