Protein–RNA interactions for Protein: A8K0S8

MEIS3P2, Putative homeobox protein Meis3-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P2A8K0S8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms