Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms