Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC169A6NNP5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms