Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms