Protein–RNA interactions for Protein: A6NDD5

SYNDIG1L, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1LA6NDD5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SYNDIG1LA6NDD5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNDIG1LA6NDD5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms