Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PALM3A6NDB9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PALM3A6NDB9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms