Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VWA3AA6NCI4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms