Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCHNA4D1U4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms