Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC9.06□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SSPOA2VEC9 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms