Protein–RNA interactions for Protein: A2RTX5

TARSL2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARSL2A2RTX5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TARSL2A2RTX5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms