Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPDC1A2A3K4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms