Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RRI6

CENPVL3, Centromere protein V-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPVL3A0A0U1RRI6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms