Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
NRXN3Q9Y4C0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
NRXN3Q9Y4C0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
NRXN3Q9Y4C0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
NRXN3Q9Y4C0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
NRXN3Q9Y4C0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
NRXN3Q9Y4C0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
NRXN3Q9Y4C0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
NRXN3Q9Y4C0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
NRXN3Q9Y4C0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
NRXN3Q9Y4C0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
NRXN3Q9Y4C0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
NRXN3Q9Y4C0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
NRXN3Q9Y4C0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
NRXN3Q9Y4C0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
NRXN3Q9Y4C0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
NRXN3Q9Y4C0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
NRXN3Q9Y4C0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
NRXN3Q9Y4C0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
NRXN3Q9Y4C0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
NRXN3Q9Y4C0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
NRXN3Q9Y4C0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC37.86■■■■□ 3.65
NRXN3Q9Y4C0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
NRXN3Q9Y4C0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
NRXN3Q9Y4C0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
NRXN3Q9Y4C0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
NRXN3Q9Y4C0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
NRXN3Q9Y4C0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
NRXN3Q9Y4C0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
NRXN3Q9Y4C0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
NRXN3Q9Y4C0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
NRXN3Q9Y4C0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
NRXN3Q9Y4C0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
NRXN3Q9Y4C0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
NRXN3Q9Y4C0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
NRXN3Q9Y4C0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
NRXN3Q9Y4C0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
NRXN3Q9Y4C0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
NRXN3Q9Y4C0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
NRXN3Q9Y4C0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
NRXN3Q9Y4C0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
NRXN3Q9Y4C0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.63
NRXN3Q9Y4C0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
NRXN3Q9Y4C0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
NRXN3Q9Y4C0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
NRXN3Q9Y4C0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
NRXN3Q9Y4C0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
NRXN3Q9Y4C0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
NRXN3Q9Y4C0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
NRXN3Q9Y4C0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
NRXN3Q9Y4C0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
NRXN3Q9Y4C0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
NRXN3Q9Y4C0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
NRXN3Q9Y4C0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
NRXN3Q9Y4C0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
NRXN3Q9Y4C0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
NRXN3Q9Y4C0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
NRXN3Q9Y4C0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
NRXN3Q9Y4C0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
NRXN3Q9Y4C0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
NRXN3Q9Y4C0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
NRXN3Q9Y4C0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
NRXN3Q9Y4C0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
NRXN3Q9Y4C0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
NRXN3Q9Y4C0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
NRXN3Q9Y4C0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
NRXN3Q9Y4C0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
NRXN3Q9Y4C0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
NRXN3Q9Y4C0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
NRXN3Q9Y4C0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
NRXN3Q9Y4C0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
NRXN3Q9Y4C0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
NRXN3Q9Y4C0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
NRXN3Q9Y4C0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
NRXN3Q9Y4C0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
NRXN3Q9Y4C0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
NRXN3Q9Y4C0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
NRXN3Q9Y4C0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
NRXN3Q9Y4C0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
NRXN3Q9Y4C0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
NRXN3Q9Y4C0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
NRXN3Q9Y4C0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC37.54■■■■□ 3.6
NRXN3Q9Y4C0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
NRXN3Q9Y4C0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
NRXN3Q9Y4C0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
NRXN3Q9Y4C0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
NRXN3Q9Y4C0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
NRXN3Q9Y4C0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
NRXN3Q9Y4C0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
NRXN3Q9Y4C0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
NRXN3Q9Y4C0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
NRXN3Q9Y4C0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
NRXN3Q9Y4C0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
NRXN3Q9Y4C0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
NRXN3Q9Y4C0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
NRXN3Q9Y4C0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
NRXN3Q9Y4C0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
NRXN3Q9Y4C0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
NRXN3Q9Y4C0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
NRXN3Q9Y4C0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms