Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFD9

RIMBP3, RIMS-binding protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP3Q9UFD9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
RIMBP3Q9UFD9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC44.01■■■■■ 4.64
RIMBP3Q9UFD9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC44■■■■■ 4.63
RIMBP3Q9UFD9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC44■■■■■ 4.63
RIMBP3Q9UFD9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC44■■■■■ 4.63
RIMBP3Q9UFD9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
RIMBP3Q9UFD9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC43.96■■■■■ 4.63
RIMBP3Q9UFD9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC43.96■■■■■ 4.63
RIMBP3Q9UFD9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.63
RIMBP3Q9UFD9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC43.94■■■■■ 4.62
RIMBP3Q9UFD9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.91■■■■■ 4.62
RIMBP3Q9UFD9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
RIMBP3Q9UFD9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
RIMBP3Q9UFD9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC43.9■■■■■ 4.62
RIMBP3Q9UFD9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
RIMBP3Q9UFD9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.62
RIMBP3Q9UFD9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC43.88■■■■■ 4.62
RIMBP3Q9UFD9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC43.88■■■■■ 4.61
RIMBP3Q9UFD9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC43.88■■■■■ 4.61
RIMBP3Q9UFD9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
RIMBP3Q9UFD9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC43.87■■■■■ 4.61
RIMBP3Q9UFD9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC43.86■■■■■ 4.61
RIMBP3Q9UFD9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC43.84■■■■■ 4.61
RIMBP3Q9UFD9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
RIMBP3Q9UFD9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
RIMBP3Q9UFD9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
RIMBP3Q9UFD9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
RIMBP3Q9UFD9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
RIMBP3Q9UFD9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
RIMBP3Q9UFD9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
RIMBP3Q9UFD9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.73■■■■■ 4.59
RIMBP3Q9UFD9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
RIMBP3Q9UFD9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC43.72■■■■■ 4.59
RIMBP3Q9UFD9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
RIMBP3Q9UFD9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.59
RIMBP3Q9UFD9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC43.68■■■■■ 4.58
RIMBP3Q9UFD9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC43.67■■■■■ 4.58
RIMBP3Q9UFD9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC43.67■■■■■ 4.58
RIMBP3Q9UFD9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC43.67■■■■■ 4.58
RIMBP3Q9UFD9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
RIMBP3Q9UFD9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC43.66■■■■■ 4.58
RIMBP3Q9UFD9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
RIMBP3Q9UFD9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
RIMBP3Q9UFD9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC43.65■■■■■ 4.58
RIMBP3Q9UFD9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
RIMBP3Q9UFD9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
RIMBP3Q9UFD9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC43.64■■■■■ 4.58
RIMBP3Q9UFD9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
RIMBP3Q9UFD9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
RIMBP3Q9UFD9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
RIMBP3Q9UFD9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.59■■■■■ 4.57
RIMBP3Q9UFD9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
RIMBP3Q9UFD9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
RIMBP3Q9UFD9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC43.56■■■■■ 4.56
RIMBP3Q9UFD9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.56■■■■■ 4.56
RIMBP3Q9UFD9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC43.55■■■■■ 4.56
RIMBP3Q9UFD9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC43.55■■■■■ 4.56
RIMBP3Q9UFD9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC43.53■■■■■ 4.56
RIMBP3Q9UFD9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC43.53■■■■■ 4.56
RIMBP3Q9UFD9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
RIMBP3Q9UFD9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC43.51■■■■■ 4.56
RIMBP3Q9UFD9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
RIMBP3Q9UFD9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC43.5■■■■■ 4.55
RIMBP3Q9UFD9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
RIMBP3Q9UFD9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
RIMBP3Q9UFD9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
RIMBP3Q9UFD9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
RIMBP3Q9UFD9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC43.48■■■■■ 4.55
RIMBP3Q9UFD9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.48■■■■■ 4.55
RIMBP3Q9UFD9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC43.47■■■■■ 4.55
RIMBP3Q9UFD9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC43.47■■■■■ 4.55
RIMBP3Q9UFD9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC43.47■■■■■ 4.55
RIMBP3Q9UFD9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC43.47■■■■■ 4.55
RIMBP3Q9UFD9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
RIMBP3Q9UFD9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.45■■■■■ 4.55
RIMBP3Q9UFD9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC43.44■■■■■ 4.55
RIMBP3Q9UFD9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC43.44■■■■■ 4.54
RIMBP3Q9UFD9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC43.43■■■■■ 4.54
RIMBP3Q9UFD9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC43.42■■■■■ 4.54
RIMBP3Q9UFD9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
RIMBP3Q9UFD9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
RIMBP3Q9UFD9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC43.39■■■■■ 4.54
RIMBP3Q9UFD9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC43.38■■■■■ 4.54
RIMBP3Q9UFD9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC43.37■■■■■ 4.53
RIMBP3Q9UFD9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC43.37■■■■■ 4.53
RIMBP3Q9UFD9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
RIMBP3Q9UFD9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
RIMBP3Q9UFD9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
RIMBP3Q9UFD9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC43.35■■■■■ 4.53
RIMBP3Q9UFD9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
RIMBP3Q9UFD9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC43.33■■■■■ 4.53
RIMBP3Q9UFD9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
RIMBP3Q9UFD9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
RIMBP3Q9UFD9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
RIMBP3Q9UFD9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
RIMBP3Q9UFD9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC43.3■■■■■ 4.52
RIMBP3Q9UFD9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC43.28■■■■■ 4.52
RIMBP3Q9UFD9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
RIMBP3Q9UFD9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC43.27■■■■■ 4.52
RIMBP3Q9UFD9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms