Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALKBH4Q9NXW9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
ALKBH4Q9NXW9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALKBH4Q9NXW9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALKBH4Q9NXW9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ALKBH4Q9NXW9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ALKBH4Q9NXW9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ALKBH4Q9NXW9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ALKBH4Q9NXW9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ALKBH4Q9NXW9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALKBH4Q9NXW9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALKBH4Q9NXW9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALKBH4Q9NXW9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ALKBH4Q9NXW9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ALKBH4Q9NXW9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALKBH4Q9NXW9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALKBH4Q9NXW9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALKBH4Q9NXW9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALKBH4Q9NXW9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALKBH4Q9NXW9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALKBH4Q9NXW9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALKBH4Q9NXW9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALKBH4Q9NXW9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALKBH4Q9NXW9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALKBH4Q9NXW9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALKBH4Q9NXW9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALKBH4Q9NXW9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALKBH4Q9NXW9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALKBH4Q9NXW9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ALKBH4Q9NXW9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALKBH4Q9NXW9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALKBH4Q9NXW9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALKBH4Q9NXW9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALKBH4Q9NXW9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALKBH4Q9NXW9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALKBH4Q9NXW9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALKBH4Q9NXW9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALKBH4Q9NXW9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALKBH4Q9NXW9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALKBH4Q9NXW9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ALKBH4Q9NXW9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALKBH4Q9NXW9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ALKBH4Q9NXW9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ALKBH4Q9NXW9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALKBH4Q9NXW9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALKBH4Q9NXW9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALKBH4Q9NXW9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALKBH4Q9NXW9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ALKBH4Q9NXW9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ALKBH4Q9NXW9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALKBH4Q9NXW9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALKBH4Q9NXW9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALKBH4Q9NXW9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALKBH4Q9NXW9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALKBH4Q9NXW9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALKBH4Q9NXW9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALKBH4Q9NXW9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALKBH4Q9NXW9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ALKBH4Q9NXW9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALKBH4Q9NXW9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALKBH4Q9NXW9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALKBH4Q9NXW9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALKBH4Q9NXW9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALKBH4Q9NXW9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALKBH4Q9NXW9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALKBH4Q9NXW9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALKBH4Q9NXW9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ALKBH4Q9NXW9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALKBH4Q9NXW9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALKBH4Q9NXW9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ALKBH4Q9NXW9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ALKBH4Q9NXW9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ALKBH4Q9NXW9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ALKBH4Q9NXW9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ALKBH4Q9NXW9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ALKBH4Q9NXW9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALKBH4Q9NXW9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALKBH4Q9NXW9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALKBH4Q9NXW9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALKBH4Q9NXW9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALKBH4Q9NXW9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALKBH4Q9NXW9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALKBH4Q9NXW9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALKBH4Q9NXW9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALKBH4Q9NXW9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALKBH4Q9NXW9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALKBH4Q9NXW9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALKBH4Q9NXW9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALKBH4Q9NXW9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALKBH4Q9NXW9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALKBH4Q9NXW9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALKBH4Q9NXW9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALKBH4Q9NXW9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALKBH4Q9NXW9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALKBH4Q9NXW9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALKBH4Q9NXW9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALKBH4Q9NXW9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALKBH4Q9NXW9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALKBH4Q9NXW9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALKBH4Q9NXW9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.3 ms