Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVH0

EXD2, Exonuclease 3'-5' domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXD2Q9NVH0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EXD2Q9NVH0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EXD2Q9NVH0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EXD2Q9NVH0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EXD2Q9NVH0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EXD2Q9NVH0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXD2Q9NVH0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXD2Q9NVH0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXD2Q9NVH0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXD2Q9NVH0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EXD2Q9NVH0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EXD2Q9NVH0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EXD2Q9NVH0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EXD2Q9NVH0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
EXD2Q9NVH0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EXD2Q9NVH0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EXD2Q9NVH0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EXD2Q9NVH0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EXD2Q9NVH0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EXD2Q9NVH0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EXD2Q9NVH0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EXD2Q9NVH0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
EXD2Q9NVH0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EXD2Q9NVH0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EXD2Q9NVH0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EXD2Q9NVH0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
EXD2Q9NVH0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EXD2Q9NVH0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EXD2Q9NVH0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EXD2Q9NVH0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EXD2Q9NVH0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
EXD2Q9NVH0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
EXD2Q9NVH0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EXD2Q9NVH0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EXD2Q9NVH0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
EXD2Q9NVH0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EXD2Q9NVH0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EXD2Q9NVH0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EXD2Q9NVH0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EXD2Q9NVH0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EXD2Q9NVH0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EXD2Q9NVH0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EXD2Q9NVH0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXD2Q9NVH0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXD2Q9NVH0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXD2Q9NVH0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXD2Q9NVH0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXD2Q9NVH0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXD2Q9NVH0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXD2Q9NVH0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EXD2Q9NVH0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXD2Q9NVH0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXD2Q9NVH0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXD2Q9NVH0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXD2Q9NVH0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXD2Q9NVH0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXD2Q9NVH0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXD2Q9NVH0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXD2Q9NVH0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXD2Q9NVH0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXD2Q9NVH0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXD2Q9NVH0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXD2Q9NVH0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXD2Q9NVH0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXD2Q9NVH0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EXD2Q9NVH0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EXD2Q9NVH0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EXD2Q9NVH0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EXD2Q9NVH0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EXD2Q9NVH0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EXD2Q9NVH0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EXD2Q9NVH0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EXD2Q9NVH0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
EXD2Q9NVH0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EXD2Q9NVH0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EXD2Q9NVH0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EXD2Q9NVH0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EXD2Q9NVH0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EXD2Q9NVH0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EXD2Q9NVH0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXD2Q9NVH0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
EXD2Q9NVH0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXD2Q9NVH0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXD2Q9NVH0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXD2Q9NVH0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXD2Q9NVH0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXD2Q9NVH0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXD2Q9NVH0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EXD2Q9NVH0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EXD2Q9NVH0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EXD2Q9NVH0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EXD2Q9NVH0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXD2Q9NVH0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXD2Q9NVH0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXD2Q9NVH0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXD2Q9NVH0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXD2Q9NVH0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EXD2Q9NVH0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EXD2Q9NVH0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXD2Q9NVH0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms