Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR33

POLE4, DNA polymerase epsilon subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE4Q9NR33 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLE4Q9NR33 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLE4Q9NR33 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLE4Q9NR33 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
POLE4Q9NR33 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLE4Q9NR33 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLE4Q9NR33 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLE4Q9NR33 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLE4Q9NR33 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLE4Q9NR33 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLE4Q9NR33 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLE4Q9NR33 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLE4Q9NR33 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLE4Q9NR33 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLE4Q9NR33 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLE4Q9NR33 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLE4Q9NR33 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLE4Q9NR33 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
POLE4Q9NR33 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
POLE4Q9NR33 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLE4Q9NR33 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLE4Q9NR33 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLE4Q9NR33 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLE4Q9NR33 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLE4Q9NR33 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLE4Q9NR33 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLE4Q9NR33 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLE4Q9NR33 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLE4Q9NR33 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLE4Q9NR33 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLE4Q9NR33 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLE4Q9NR33 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLE4Q9NR33 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLE4Q9NR33 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLE4Q9NR33 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLE4Q9NR33 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLE4Q9NR33 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLE4Q9NR33 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLE4Q9NR33 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLE4Q9NR33 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLE4Q9NR33 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLE4Q9NR33 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLE4Q9NR33 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLE4Q9NR33 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLE4Q9NR33 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLE4Q9NR33 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLE4Q9NR33 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLE4Q9NR33 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLE4Q9NR33 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLE4Q9NR33 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLE4Q9NR33 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLE4Q9NR33 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLE4Q9NR33 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLE4Q9NR33 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLE4Q9NR33 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLE4Q9NR33 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLE4Q9NR33 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLE4Q9NR33 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLE4Q9NR33 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLE4Q9NR33 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLE4Q9NR33 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLE4Q9NR33 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLE4Q9NR33 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLE4Q9NR33 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLE4Q9NR33 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLE4Q9NR33 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLE4Q9NR33 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
POLE4Q9NR33 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLE4Q9NR33 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLE4Q9NR33 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLE4Q9NR33 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLE4Q9NR33 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLE4Q9NR33 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLE4Q9NR33 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLE4Q9NR33 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
POLE4Q9NR33 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLE4Q9NR33 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLE4Q9NR33 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLE4Q9NR33 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLE4Q9NR33 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLE4Q9NR33 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLE4Q9NR33 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLE4Q9NR33 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLE4Q9NR33 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLE4Q9NR33 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLE4Q9NR33 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLE4Q9NR33 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLE4Q9NR33 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLE4Q9NR33 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLE4Q9NR33 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLE4Q9NR33 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLE4Q9NR33 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
POLE4Q9NR33 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLE4Q9NR33 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLE4Q9NR33 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLE4Q9NR33 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLE4Q9NR33 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLE4Q9NR33 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
POLE4Q9NR33 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLE4Q9NR33 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms