Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
COG4Q9H9E3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
COG4Q9H9E3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
COG4Q9H9E3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
COG4Q9H9E3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
COG4Q9H9E3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
COG4Q9H9E3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
COG4Q9H9E3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
COG4Q9H9E3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
COG4Q9H9E3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
COG4Q9H9E3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
COG4Q9H9E3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COG4Q9H9E3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COG4Q9H9E3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
COG4Q9H9E3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
COG4Q9H9E3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
COG4Q9H9E3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
COG4Q9H9E3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COG4Q9H9E3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COG4Q9H9E3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COG4Q9H9E3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COG4Q9H9E3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
COG4Q9H9E3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COG4Q9H9E3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COG4Q9H9E3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COG4Q9H9E3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COG4Q9H9E3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COG4Q9H9E3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
COG4Q9H9E3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COG4Q9H9E3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COG4Q9H9E3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COG4Q9H9E3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COG4Q9H9E3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COG4Q9H9E3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COG4Q9H9E3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COG4Q9H9E3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COG4Q9H9E3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COG4Q9H9E3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COG4Q9H9E3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COG4Q9H9E3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COG4Q9H9E3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COG4Q9H9E3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COG4Q9H9E3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COG4Q9H9E3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COG4Q9H9E3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COG4Q9H9E3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COG4Q9H9E3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COG4Q9H9E3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COG4Q9H9E3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
COG4Q9H9E3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
COG4Q9H9E3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COG4Q9H9E3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COG4Q9H9E3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COG4Q9H9E3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
COG4Q9H9E3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COG4Q9H9E3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COG4Q9H9E3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COG4Q9H9E3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COG4Q9H9E3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COG4Q9H9E3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COG4Q9H9E3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COG4Q9H9E3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COG4Q9H9E3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COG4Q9H9E3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COG4Q9H9E3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COG4Q9H9E3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COG4Q9H9E3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COG4Q9H9E3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COG4Q9H9E3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COG4Q9H9E3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COG4Q9H9E3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COG4Q9H9E3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COG4Q9H9E3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COG4Q9H9E3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COG4Q9H9E3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COG4Q9H9E3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COG4Q9H9E3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COG4Q9H9E3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COG4Q9H9E3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COG4Q9H9E3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COG4Q9H9E3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COG4Q9H9E3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COG4Q9H9E3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COG4Q9H9E3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COG4Q9H9E3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
COG4Q9H9E3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COG4Q9H9E3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COG4Q9H9E3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COG4Q9H9E3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COG4Q9H9E3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COG4Q9H9E3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COG4Q9H9E3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
COG4Q9H9E3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COG4Q9H9E3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COG4Q9H9E3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COG4Q9H9E3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COG4Q9H9E3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COG4Q9H9E3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COG4Q9H9E3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COG4Q9H9E3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms