Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ40

Mrpl49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl49Q9CQ40 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrpl49Q9CQ40 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrpl49Q9CQ40 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrpl49Q9CQ40 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrpl49Q9CQ40 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mrpl49Q9CQ40 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mrpl49Q9CQ40 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Mrpl49Q9CQ40 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mrpl49Q9CQ40 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mrpl49Q9CQ40 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mrpl49Q9CQ40 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mrpl49Q9CQ40 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mrpl49Q9CQ40 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mrpl49Q9CQ40 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mrpl49Q9CQ40 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mrpl49Q9CQ40 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mrpl49Q9CQ40 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mrpl49Q9CQ40 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mrpl49Q9CQ40 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mrpl49Q9CQ40 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Mrpl49Q9CQ40 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mrpl49Q9CQ40 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mrpl49Q9CQ40 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mrpl49Q9CQ40 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mrpl49Q9CQ40 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mrpl49Q9CQ40 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mrpl49Q9CQ40 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mrpl49Q9CQ40 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mrpl49Q9CQ40 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mrpl49Q9CQ40 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mrpl49Q9CQ40 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Mrpl49Q9CQ40 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mrpl49Q9CQ40 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mrpl49Q9CQ40 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mrpl49Q9CQ40 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mrpl49Q9CQ40 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mrpl49Q9CQ40 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mrpl49Q9CQ40 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Mrpl49Q9CQ40 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mrpl49Q9CQ40 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mrpl49Q9CQ40 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mrpl49Q9CQ40 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Mrpl49Q9CQ40 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mrpl49Q9CQ40 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mrpl49Q9CQ40 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mrpl49Q9CQ40 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mrpl49Q9CQ40 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mrpl49Q9CQ40 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mrpl49Q9CQ40 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mrpl49Q9CQ40 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mrpl49Q9CQ40 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mrpl49Q9CQ40 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mrpl49Q9CQ40 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mrpl49Q9CQ40 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mrpl49Q9CQ40 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mrpl49Q9CQ40 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mrpl49Q9CQ40 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mrpl49Q9CQ40 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mrpl49Q9CQ40 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mrpl49Q9CQ40 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mrpl49Q9CQ40 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mrpl49Q9CQ40 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mrpl49Q9CQ40 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mrpl49Q9CQ40 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mrpl49Q9CQ40 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mrpl49Q9CQ40 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mrpl49Q9CQ40 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mrpl49Q9CQ40 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mrpl49Q9CQ40 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mrpl49Q9CQ40 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mrpl49Q9CQ40 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mrpl49Q9CQ40 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mrpl49Q9CQ40 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mrpl49Q9CQ40 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Mrpl49Q9CQ40 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mrpl49Q9CQ40 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mrpl49Q9CQ40 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mrpl49Q9CQ40 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mrpl49Q9CQ40 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mrpl49Q9CQ40 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mrpl49Q9CQ40 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mrpl49Q9CQ40 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mrpl49Q9CQ40 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Mrpl49Q9CQ40 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mrpl49Q9CQ40 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Mrpl49Q9CQ40 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mrpl49Q9CQ40 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mrpl49Q9CQ40 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Mrpl49Q9CQ40 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mrpl49Q9CQ40 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mrpl49Q9CQ40 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mrpl49Q9CQ40 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mrpl49Q9CQ40 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mrpl49Q9CQ40 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mrpl49Q9CQ40 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mrpl49Q9CQ40 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mrpl49Q9CQ40 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mrpl49Q9CQ40 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mrpl49Q9CQ40 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mrpl49Q9CQ40 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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