Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC35.7■■■■□ 3.3
RGPD5Q99666 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
RGPD5Q99666 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
RGPD5Q99666 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
RGPD5Q99666 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
RGPD5Q99666 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
RGPD5Q99666 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
RGPD5Q99666 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
RGPD5Q99666 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
RGPD5Q99666 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
RGPD5Q99666 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
RGPD5Q99666 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
RGPD5Q99666 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
RGPD5Q99666 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
RGPD5Q99666 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
RGPD5Q99666 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
RGPD5Q99666 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
RGPD5Q99666 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
RGPD5Q99666 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
RGPD5Q99666 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
RGPD5Q99666 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
RGPD5Q99666 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
RGPD5Q99666 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
RGPD5Q99666 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
RGPD5Q99666 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
RGPD5Q99666 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
RGPD5Q99666 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
RGPD5Q99666 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
RGPD5Q99666 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
RGPD5Q99666 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
RGPD5Q99666 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
RGPD5Q99666 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC35.59■■■■□ 3.29
RGPD5Q99666 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
RGPD5Q99666 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
RGPD5Q99666 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
RGPD5Q99666 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
RGPD5Q99666 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
RGPD5Q99666 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
RGPD5Q99666 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
RGPD5Q99666 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
RGPD5Q99666 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
RGPD5Q99666 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
RGPD5Q99666 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
RGPD5Q99666 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
RGPD5Q99666 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
RGPD5Q99666 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
RGPD5Q99666 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
RGPD5Q99666 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
RGPD5Q99666 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
RGPD5Q99666 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
RGPD5Q99666 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
RGPD5Q99666 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
RGPD5Q99666 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
RGPD5Q99666 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
RGPD5Q99666 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
RGPD5Q99666 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
RGPD5Q99666 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
RGPD5Q99666 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
RGPD5Q99666 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
RGPD5Q99666 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
RGPD5Q99666 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
RGPD5Q99666 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
RGPD5Q99666 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
RGPD5Q99666 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
RGPD5Q99666 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
RGPD5Q99666 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
RGPD5Q99666 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
RGPD5Q99666 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
RGPD5Q99666 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
RGPD5Q99666 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
RGPD5Q99666 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
RGPD5Q99666 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
RGPD5Q99666 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
RGPD5Q99666 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
RGPD5Q99666 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
RGPD5Q99666 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
RGPD5Q99666 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
RGPD5Q99666 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
RGPD5Q99666 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
RGPD5Q99666 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
RGPD5Q99666 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
RGPD5Q99666 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
RGPD5Q99666 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
RGPD5Q99666 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
RGPD5Q99666 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC35.26■■■■□ 3.23
RGPD5Q99666 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
RGPD5Q99666 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
RGPD5Q99666 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
RGPD5Q99666 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
RGPD5Q99666 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
RGPD5Q99666 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
RGPD5Q99666 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
RGPD5Q99666 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
RGPD5Q99666 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
RGPD5Q99666 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
RGPD5Q99666 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
RGPD5Q99666 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
RGPD5Q99666 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
RGPD5Q99666 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
RGPD5Q99666 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms