Protein–RNA interactions for Protein: Q96NE9

FRMD6, FERM domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD6Q96NE9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FRMD6Q96NE9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FRMD6Q96NE9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FRMD6Q96NE9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FRMD6Q96NE9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FRMD6Q96NE9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FRMD6Q96NE9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FRMD6Q96NE9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FRMD6Q96NE9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FRMD6Q96NE9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FRMD6Q96NE9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FRMD6Q96NE9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRMD6Q96NE9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRMD6Q96NE9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FRMD6Q96NE9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FRMD6Q96NE9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FRMD6Q96NE9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FRMD6Q96NE9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRMD6Q96NE9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRMD6Q96NE9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRMD6Q96NE9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRMD6Q96NE9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMD6Q96NE9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMD6Q96NE9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMD6Q96NE9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMD6Q96NE9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMD6Q96NE9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMD6Q96NE9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMD6Q96NE9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMD6Q96NE9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMD6Q96NE9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMD6Q96NE9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMD6Q96NE9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMD6Q96NE9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMD6Q96NE9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMD6Q96NE9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMD6Q96NE9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMD6Q96NE9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FRMD6Q96NE9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FRMD6Q96NE9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FRMD6Q96NE9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FRMD6Q96NE9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FRMD6Q96NE9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FRMD6Q96NE9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FRMD6Q96NE9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FRMD6Q96NE9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FRMD6Q96NE9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FRMD6Q96NE9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FRMD6Q96NE9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMD6Q96NE9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMD6Q96NE9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMD6Q96NE9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRMD6Q96NE9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRMD6Q96NE9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FRMD6Q96NE9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRMD6Q96NE9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRMD6Q96NE9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMD6Q96NE9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMD6Q96NE9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMD6Q96NE9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMD6Q96NE9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMD6Q96NE9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRMD6Q96NE9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRMD6Q96NE9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FRMD6Q96NE9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FRMD6Q96NE9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRMD6Q96NE9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRMD6Q96NE9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FRMD6Q96NE9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRMD6Q96NE9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRMD6Q96NE9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRMD6Q96NE9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRMD6Q96NE9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRMD6Q96NE9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRMD6Q96NE9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRMD6Q96NE9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRMD6Q96NE9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMD6Q96NE9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMD6Q96NE9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMD6Q96NE9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMD6Q96NE9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FRMD6Q96NE9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FRMD6Q96NE9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FRMD6Q96NE9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FRMD6Q96NE9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FRMD6Q96NE9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FRMD6Q96NE9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FRMD6Q96NE9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FRMD6Q96NE9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FRMD6Q96NE9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FRMD6Q96NE9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FRMD6Q96NE9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FRMD6Q96NE9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMD6Q96NE9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMD6Q96NE9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMD6Q96NE9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMD6Q96NE9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FRMD6Q96NE9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FRMD6Q96NE9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FRMD6Q96NE9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms