Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN8

NEURL4, Neuralized-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL4Q96JN8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
NEURL4Q96JN8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
NEURL4Q96JN8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
NEURL4Q96JN8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
NEURL4Q96JN8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
NEURL4Q96JN8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
NEURL4Q96JN8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
NEURL4Q96JN8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
NEURL4Q96JN8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
NEURL4Q96JN8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
NEURL4Q96JN8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
NEURL4Q96JN8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
NEURL4Q96JN8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
NEURL4Q96JN8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
NEURL4Q96JN8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
NEURL4Q96JN8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
NEURL4Q96JN8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
NEURL4Q96JN8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
NEURL4Q96JN8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
NEURL4Q96JN8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC38.8■■■■□ 3.8
NEURL4Q96JN8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
NEURL4Q96JN8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
NEURL4Q96JN8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
NEURL4Q96JN8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
NEURL4Q96JN8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
NEURL4Q96JN8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
NEURL4Q96JN8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
NEURL4Q96JN8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
NEURL4Q96JN8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
NEURL4Q96JN8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
NEURL4Q96JN8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
NEURL4Q96JN8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
NEURL4Q96JN8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
NEURL4Q96JN8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
NEURL4Q96JN8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
NEURL4Q96JN8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC38.76■■■■□ 3.8
NEURL4Q96JN8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
NEURL4Q96JN8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
NEURL4Q96JN8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
NEURL4Q96JN8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
NEURL4Q96JN8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC38.7■■■■□ 3.79
NEURL4Q96JN8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
NEURL4Q96JN8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
NEURL4Q96JN8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC38.69■■■■□ 3.78
NEURL4Q96JN8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
NEURL4Q96JN8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
NEURL4Q96JN8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
NEURL4Q96JN8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.67■■■■□ 3.78
NEURL4Q96JN8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
NEURL4Q96JN8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC38.66■■■■□ 3.78
NEURL4Q96JN8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC38.65■■■■□ 3.78
NEURL4Q96JN8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
NEURL4Q96JN8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
NEURL4Q96JN8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
NEURL4Q96JN8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
NEURL4Q96JN8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
NEURL4Q96JN8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
NEURL4Q96JN8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
NEURL4Q96JN8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
NEURL4Q96JN8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
NEURL4Q96JN8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.77
NEURL4Q96JN8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
NEURL4Q96JN8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC38.62■■■■□ 3.77
NEURL4Q96JN8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
NEURL4Q96JN8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
NEURL4Q96JN8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
NEURL4Q96JN8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
NEURL4Q96JN8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
NEURL4Q96JN8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
NEURL4Q96JN8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.55■■■■□ 3.76
NEURL4Q96JN8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
NEURL4Q96JN8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
NEURL4Q96JN8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
NEURL4Q96JN8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
NEURL4Q96JN8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
NEURL4Q96JN8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
NEURL4Q96JN8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
NEURL4Q96JN8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
NEURL4Q96JN8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
NEURL4Q96JN8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
NEURL4Q96JN8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
NEURL4Q96JN8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
NEURL4Q96JN8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
NEURL4Q96JN8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
NEURL4Q96JN8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
NEURL4Q96JN8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
NEURL4Q96JN8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC38.47■■■■□ 3.75
NEURL4Q96JN8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
NEURL4Q96JN8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
NEURL4Q96JN8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
NEURL4Q96JN8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
NEURL4Q96JN8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
NEURL4Q96JN8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
NEURL4Q96JN8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
NEURL4Q96JN8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
NEURL4Q96JN8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.42■■■■□ 3.74
NEURL4Q96JN8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
NEURL4Q96JN8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
NEURL4Q96JN8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
NEURL4Q96JN8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms