Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY3

LIN37, Protein lin-37 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN37Q96GY3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LIN37Q96GY3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LIN37Q96GY3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LIN37Q96GY3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LIN37Q96GY3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LIN37Q96GY3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LIN37Q96GY3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LIN37Q96GY3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LIN37Q96GY3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LIN37Q96GY3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LIN37Q96GY3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LIN37Q96GY3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIN37Q96GY3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIN37Q96GY3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LIN37Q96GY3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LIN37Q96GY3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LIN37Q96GY3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LIN37Q96GY3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LIN37Q96GY3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LIN37Q96GY3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LIN37Q96GY3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LIN37Q96GY3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LIN37Q96GY3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LIN37Q96GY3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LIN37Q96GY3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LIN37Q96GY3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LIN37Q96GY3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LIN37Q96GY3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LIN37Q96GY3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LIN37Q96GY3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LIN37Q96GY3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LIN37Q96GY3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LIN37Q96GY3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LIN37Q96GY3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LIN37Q96GY3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LIN37Q96GY3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LIN37Q96GY3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LIN37Q96GY3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LIN37Q96GY3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LIN37Q96GY3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LIN37Q96GY3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LIN37Q96GY3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LIN37Q96GY3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LIN37Q96GY3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LIN37Q96GY3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LIN37Q96GY3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LIN37Q96GY3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LIN37Q96GY3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LIN37Q96GY3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LIN37Q96GY3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LIN37Q96GY3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIN37Q96GY3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIN37Q96GY3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIN37Q96GY3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LIN37Q96GY3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LIN37Q96GY3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LIN37Q96GY3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LIN37Q96GY3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIN37Q96GY3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIN37Q96GY3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIN37Q96GY3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LIN37Q96GY3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LIN37Q96GY3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LIN37Q96GY3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LIN37Q96GY3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LIN37Q96GY3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LIN37Q96GY3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LIN37Q96GY3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LIN37Q96GY3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LIN37Q96GY3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LIN37Q96GY3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LIN37Q96GY3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LIN37Q96GY3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LIN37Q96GY3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LIN37Q96GY3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LIN37Q96GY3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LIN37Q96GY3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LIN37Q96GY3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LIN37Q96GY3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LIN37Q96GY3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LIN37Q96GY3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LIN37Q96GY3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LIN37Q96GY3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LIN37Q96GY3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LIN37Q96GY3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LIN37Q96GY3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LIN37Q96GY3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LIN37Q96GY3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LIN37Q96GY3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LIN37Q96GY3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LIN37Q96GY3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LIN37Q96GY3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LIN37Q96GY3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LIN37Q96GY3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LIN37Q96GY3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LIN37Q96GY3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LIN37Q96GY3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LIN37Q96GY3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LIN37Q96GY3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LIN37Q96GY3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms