Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
SIRT1Q96EB6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
SIRT1Q96EB6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
SIRT1Q96EB6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
SIRT1Q96EB6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
SIRT1Q96EB6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
SIRT1Q96EB6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
SIRT1Q96EB6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
SIRT1Q96EB6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
SIRT1Q96EB6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
SIRT1Q96EB6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
SIRT1Q96EB6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
SIRT1Q96EB6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC37.3■■■■□ 3.56
SIRT1Q96EB6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
SIRT1Q96EB6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
SIRT1Q96EB6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
SIRT1Q96EB6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
SIRT1Q96EB6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
SIRT1Q96EB6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
SIRT1Q96EB6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
SIRT1Q96EB6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
SIRT1Q96EB6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
SIRT1Q96EB6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
SIRT1Q96EB6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
SIRT1Q96EB6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
SIRT1Q96EB6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
SIRT1Q96EB6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC37.19■■■■□ 3.54
SIRT1Q96EB6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
SIRT1Q96EB6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
SIRT1Q96EB6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
SIRT1Q96EB6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
SIRT1Q96EB6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
SIRT1Q96EB6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
SIRT1Q96EB6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
SIRT1Q96EB6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
SIRT1Q96EB6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
SIRT1Q96EB6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
SIRT1Q96EB6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
SIRT1Q96EB6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
SIRT1Q96EB6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
SIRT1Q96EB6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
SIRT1Q96EB6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
SIRT1Q96EB6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
SIRT1Q96EB6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
SIRT1Q96EB6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
SIRT1Q96EB6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
SIRT1Q96EB6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
SIRT1Q96EB6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
SIRT1Q96EB6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
SIRT1Q96EB6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
SIRT1Q96EB6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
SIRT1Q96EB6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
SIRT1Q96EB6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
SIRT1Q96EB6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
SIRT1Q96EB6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
SIRT1Q96EB6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
SIRT1Q96EB6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
SIRT1Q96EB6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
SIRT1Q96EB6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
SIRT1Q96EB6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
SIRT1Q96EB6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.51
SIRT1Q96EB6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
SIRT1Q96EB6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
SIRT1Q96EB6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
SIRT1Q96EB6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
SIRT1Q96EB6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
SIRT1Q96EB6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
SIRT1Q96EB6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
SIRT1Q96EB6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
SIRT1Q96EB6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
SIRT1Q96EB6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
SIRT1Q96EB6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
SIRT1Q96EB6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
SIRT1Q96EB6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
SIRT1Q96EB6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
SIRT1Q96EB6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
SIRT1Q96EB6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
SIRT1Q96EB6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
SIRT1Q96EB6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
SIRT1Q96EB6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
SIRT1Q96EB6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
SIRT1Q96EB6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
SIRT1Q96EB6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
SIRT1Q96EB6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
SIRT1Q96EB6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
SIRT1Q96EB6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
SIRT1Q96EB6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
SIRT1Q96EB6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
SIRT1Q96EB6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SIRT1Q96EB6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SIRT1Q96EB6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SIRT1Q96EB6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SIRT1Q96EB6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
SIRT1Q96EB6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SIRT1Q96EB6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SIRT1Q96EB6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SIRT1Q96EB6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SIRT1Q96EB6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SIRT1Q96EB6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SIRT1Q96EB6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms