Protein–RNA interactions for Protein: Q91VJ2

Cavin3, Caveolae-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin3Q91VJ2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cavin3Q91VJ2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cavin3Q91VJ2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cavin3Q91VJ2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cavin3Q91VJ2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cavin3Q91VJ2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cavin3Q91VJ2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cavin3Q91VJ2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cavin3Q91VJ2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cavin3Q91VJ2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cavin3Q91VJ2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cavin3Q91VJ2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cavin3Q91VJ2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cavin3Q91VJ2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cavin3Q91VJ2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cavin3Q91VJ2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cavin3Q91VJ2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cavin3Q91VJ2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cavin3Q91VJ2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cavin3Q91VJ2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cavin3Q91VJ2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cavin3Q91VJ2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cavin3Q91VJ2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cavin3Q91VJ2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cavin3Q91VJ2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cavin3Q91VJ2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cavin3Q91VJ2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cavin3Q91VJ2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cavin3Q91VJ2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cavin3Q91VJ2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cavin3Q91VJ2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cavin3Q91VJ2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cavin3Q91VJ2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cavin3Q91VJ2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cavin3Q91VJ2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cavin3Q91VJ2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cavin3Q91VJ2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cavin3Q91VJ2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cavin3Q91VJ2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cavin3Q91VJ2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cavin3Q91VJ2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cavin3Q91VJ2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cavin3Q91VJ2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cavin3Q91VJ2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cavin3Q91VJ2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cavin3Q91VJ2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cavin3Q91VJ2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cavin3Q91VJ2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cavin3Q91VJ2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cavin3Q91VJ2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cavin3Q91VJ2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cavin3Q91VJ2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cavin3Q91VJ2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cavin3Q91VJ2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cavin3Q91VJ2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cavin3Q91VJ2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cavin3Q91VJ2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cavin3Q91VJ2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cavin3Q91VJ2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cavin3Q91VJ2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cavin3Q91VJ2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cavin3Q91VJ2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cavin3Q91VJ2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cavin3Q91VJ2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cavin3Q91VJ2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cavin3Q91VJ2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cavin3Q91VJ2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cavin3Q91VJ2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cavin3Q91VJ2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cavin3Q91VJ2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cavin3Q91VJ2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cavin3Q91VJ2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cavin3Q91VJ2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cavin3Q91VJ2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cavin3Q91VJ2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cavin3Q91VJ2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cavin3Q91VJ2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cavin3Q91VJ2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cavin3Q91VJ2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cavin3Q91VJ2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cavin3Q91VJ2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cavin3Q91VJ2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cavin3Q91VJ2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cavin3Q91VJ2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cavin3Q91VJ2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cavin3Q91VJ2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cavin3Q91VJ2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cavin3Q91VJ2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cavin3Q91VJ2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cavin3Q91VJ2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cavin3Q91VJ2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cavin3Q91VJ2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cavin3Q91VJ2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cavin3Q91VJ2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cavin3Q91VJ2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cavin3Q91VJ2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cavin3Q91VJ2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cavin3Q91VJ2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cavin3Q91VJ2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cavin3Q91VJ2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms