Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEU7

RAPGEF6, Rap guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF6Q8TEU7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC42.06■■■■■ 4.32
RAPGEF6Q8TEU7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC42.06■■■■■ 4.32
RAPGEF6Q8TEU7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC42.06■■■■■ 4.32
RAPGEF6Q8TEU7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC42.06■■■■■ 4.32
RAPGEF6Q8TEU7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC42.06■■■■■ 4.32
RAPGEF6Q8TEU7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC42.06■■■■■ 4.32
RAPGEF6Q8TEU7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC42.06■■■■■ 4.32
RAPGEF6Q8TEU7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC42.06■■■■■ 4.32
RAPGEF6Q8TEU7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC42.06■■■■■ 4.32
RAPGEF6Q8TEU7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
RAPGEF6Q8TEU7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
RAPGEF6Q8TEU7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
RAPGEF6Q8TEU7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC42.02■■■■■ 4.32
RAPGEF6Q8TEU7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC42.02■■■■■ 4.32
RAPGEF6Q8TEU7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.01■■■■■ 4.32
RAPGEF6Q8TEU7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
RAPGEF6Q8TEU7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
RAPGEF6Q8TEU7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC41.99■■■■■ 4.31
RAPGEF6Q8TEU7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC41.98■■■■■ 4.31
RAPGEF6Q8TEU7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
RAPGEF6Q8TEU7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
RAPGEF6Q8TEU7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
RAPGEF6Q8TEU7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC41.97■■■■■ 4.31
RAPGEF6Q8TEU7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
RAPGEF6Q8TEU7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC41.95■■■■■ 4.31
RAPGEF6Q8TEU7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
RAPGEF6Q8TEU7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
RAPGEF6Q8TEU7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC41.94■■■■■ 4.3
RAPGEF6Q8TEU7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
RAPGEF6Q8TEU7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
RAPGEF6Q8TEU7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
RAPGEF6Q8TEU7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC41.91■■■■■ 4.3
RAPGEF6Q8TEU7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
RAPGEF6Q8TEU7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
RAPGEF6Q8TEU7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
RAPGEF6Q8TEU7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.88■■■■■ 4.3
RAPGEF6Q8TEU7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
RAPGEF6Q8TEU7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
RAPGEF6Q8TEU7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC41.87■■■■■ 4.29
RAPGEF6Q8TEU7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC41.87■■■■■ 4.29
RAPGEF6Q8TEU7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
RAPGEF6Q8TEU7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC41.86■■■■■ 4.29
RAPGEF6Q8TEU7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
RAPGEF6Q8TEU7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
RAPGEF6Q8TEU7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC41.85■■■■■ 4.29
RAPGEF6Q8TEU7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
RAPGEF6Q8TEU7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
RAPGEF6Q8TEU7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.28
RAPGEF6Q8TEU7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
RAPGEF6Q8TEU7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC41.8■■■■■ 4.28
RAPGEF6Q8TEU7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC41.8■■■■■ 4.28
RAPGEF6Q8TEU7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.77■■■■■ 4.28
RAPGEF6Q8TEU7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
RAPGEF6Q8TEU7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
RAPGEF6Q8TEU7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
RAPGEF6Q8TEU7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
RAPGEF6Q8TEU7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
RAPGEF6Q8TEU7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
RAPGEF6Q8TEU7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC41.7■■■■■ 4.27
RAPGEF6Q8TEU7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.27
RAPGEF6Q8TEU7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.26
RAPGEF6Q8TEU7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
RAPGEF6Q8TEU7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC41.69■■■■■ 4.26
RAPGEF6Q8TEU7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.26
RAPGEF6Q8TEU7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
RAPGEF6Q8TEU7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
RAPGEF6Q8TEU7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC41.68■■■■■ 4.26
RAPGEF6Q8TEU7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
RAPGEF6Q8TEU7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
RAPGEF6Q8TEU7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
RAPGEF6Q8TEU7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
RAPGEF6Q8TEU7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
RAPGEF6Q8TEU7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
RAPGEF6Q8TEU7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
RAPGEF6Q8TEU7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
RAPGEF6Q8TEU7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
RAPGEF6Q8TEU7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC41.66■■■■■ 4.26
RAPGEF6Q8TEU7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC41.66■■■■■ 4.26
RAPGEF6Q8TEU7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
RAPGEF6Q8TEU7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC41.64■■■■■ 4.26
RAPGEF6Q8TEU7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
RAPGEF6Q8TEU7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
RAPGEF6Q8TEU7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
RAPGEF6Q8TEU7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
RAPGEF6Q8TEU7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
RAPGEF6Q8TEU7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
RAPGEF6Q8TEU7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.59■■■■■ 4.25
RAPGEF6Q8TEU7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
RAPGEF6Q8TEU7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
RAPGEF6Q8TEU7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC41.57■■■■■ 4.24
RAPGEF6Q8TEU7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
RAPGEF6Q8TEU7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
RAPGEF6Q8TEU7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC41.55■■■■■ 4.24
RAPGEF6Q8TEU7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC41.54■■■■■ 4.24
RAPGEF6Q8TEU7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
RAPGEF6Q8TEU7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC41.54■■■■■ 4.24
RAPGEF6Q8TEU7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
RAPGEF6Q8TEU7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
RAPGEF6Q8TEU7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
RAPGEF6Q8TEU7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms