Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBE8

KLHL23, Kelch-like protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL23Q8NBE8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KLHL23Q8NBE8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KLHL23Q8NBE8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KLHL23Q8NBE8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
KLHL23Q8NBE8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KLHL23Q8NBE8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
KLHL23Q8NBE8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
KLHL23Q8NBE8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
KLHL23Q8NBE8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
KLHL23Q8NBE8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
KLHL23Q8NBE8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
KLHL23Q8NBE8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
KLHL23Q8NBE8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
KLHL23Q8NBE8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KLHL23Q8NBE8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KLHL23Q8NBE8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KLHL23Q8NBE8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KLHL23Q8NBE8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KLHL23Q8NBE8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KLHL23Q8NBE8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KLHL23Q8NBE8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KLHL23Q8NBE8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KLHL23Q8NBE8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KLHL23Q8NBE8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KLHL23Q8NBE8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KLHL23Q8NBE8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KLHL23Q8NBE8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
KLHL23Q8NBE8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KLHL23Q8NBE8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KLHL23Q8NBE8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KLHL23Q8NBE8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KLHL23Q8NBE8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KLHL23Q8NBE8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KLHL23Q8NBE8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KLHL23Q8NBE8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KLHL23Q8NBE8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KLHL23Q8NBE8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KLHL23Q8NBE8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
KLHL23Q8NBE8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KLHL23Q8NBE8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KLHL23Q8NBE8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KLHL23Q8NBE8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KLHL23Q8NBE8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KLHL23Q8NBE8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KLHL23Q8NBE8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KLHL23Q8NBE8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KLHL23Q8NBE8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KLHL23Q8NBE8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KLHL23Q8NBE8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KLHL23Q8NBE8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KLHL23Q8NBE8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KLHL23Q8NBE8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KLHL23Q8NBE8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KLHL23Q8NBE8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KLHL23Q8NBE8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KLHL23Q8NBE8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KLHL23Q8NBE8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KLHL23Q8NBE8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KLHL23Q8NBE8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KLHL23Q8NBE8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KLHL23Q8NBE8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KLHL23Q8NBE8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KLHL23Q8NBE8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KLHL23Q8NBE8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KLHL23Q8NBE8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KLHL23Q8NBE8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KLHL23Q8NBE8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KLHL23Q8NBE8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KLHL23Q8NBE8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KLHL23Q8NBE8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KLHL23Q8NBE8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KLHL23Q8NBE8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KLHL23Q8NBE8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KLHL23Q8NBE8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KLHL23Q8NBE8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KLHL23Q8NBE8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KLHL23Q8NBE8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KLHL23Q8NBE8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KLHL23Q8NBE8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KLHL23Q8NBE8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KLHL23Q8NBE8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KLHL23Q8NBE8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KLHL23Q8NBE8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KLHL23Q8NBE8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KLHL23Q8NBE8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KLHL23Q8NBE8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KLHL23Q8NBE8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KLHL23Q8NBE8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KLHL23Q8NBE8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KLHL23Q8NBE8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KLHL23Q8NBE8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KLHL23Q8NBE8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
KLHL23Q8NBE8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
KLHL23Q8NBE8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KLHL23Q8NBE8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KLHL23Q8NBE8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KLHL23Q8NBE8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
KLHL23Q8NBE8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KLHL23Q8NBE8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KLHL23Q8NBE8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms