Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7G5

Apoa5, Apolipoprotein A-V, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa5Q8C7G5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apoa5Q8C7G5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Apoa5Q8C7G5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apoa5Q8C7G5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apoa5Q8C7G5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apoa5Q8C7G5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apoa5Q8C7G5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apoa5Q8C7G5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apoa5Q8C7G5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apoa5Q8C7G5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Apoa5Q8C7G5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apoa5Q8C7G5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apoa5Q8C7G5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apoa5Q8C7G5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apoa5Q8C7G5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apoa5Q8C7G5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Apoa5Q8C7G5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apoa5Q8C7G5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Apoa5Q8C7G5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apoa5Q8C7G5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apoa5Q8C7G5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apoa5Q8C7G5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apoa5Q8C7G5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apoa5Q8C7G5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apoa5Q8C7G5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apoa5Q8C7G5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apoa5Q8C7G5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apoa5Q8C7G5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apoa5Q8C7G5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apoa5Q8C7G5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apoa5Q8C7G5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apoa5Q8C7G5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apoa5Q8C7G5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apoa5Q8C7G5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apoa5Q8C7G5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apoa5Q8C7G5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apoa5Q8C7G5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apoa5Q8C7G5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apoa5Q8C7G5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apoa5Q8C7G5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apoa5Q8C7G5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apoa5Q8C7G5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apoa5Q8C7G5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apoa5Q8C7G5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apoa5Q8C7G5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apoa5Q8C7G5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apoa5Q8C7G5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apoa5Q8C7G5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apoa5Q8C7G5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apoa5Q8C7G5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apoa5Q8C7G5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apoa5Q8C7G5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apoa5Q8C7G5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apoa5Q8C7G5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apoa5Q8C7G5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apoa5Q8C7G5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apoa5Q8C7G5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apoa5Q8C7G5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apoa5Q8C7G5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apoa5Q8C7G5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apoa5Q8C7G5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apoa5Q8C7G5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apoa5Q8C7G5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apoa5Q8C7G5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apoa5Q8C7G5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apoa5Q8C7G5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apoa5Q8C7G5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apoa5Q8C7G5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Apoa5Q8C7G5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apoa5Q8C7G5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apoa5Q8C7G5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Apoa5Q8C7G5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Apoa5Q8C7G5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apoa5Q8C7G5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Apoa5Q8C7G5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apoa5Q8C7G5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apoa5Q8C7G5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apoa5Q8C7G5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apoa5Q8C7G5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apoa5Q8C7G5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apoa5Q8C7G5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apoa5Q8C7G5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apoa5Q8C7G5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apoa5Q8C7G5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apoa5Q8C7G5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apoa5Q8C7G5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apoa5Q8C7G5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apoa5Q8C7G5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apoa5Q8C7G5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apoa5Q8C7G5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apoa5Q8C7G5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apoa5Q8C7G5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apoa5Q8C7G5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Apoa5Q8C7G5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apoa5Q8C7G5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apoa5Q8C7G5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apoa5Q8C7G5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apoa5Q8C7G5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apoa5Q8C7G5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apoa5Q8C7G5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms